大多人都知道认定高新技术企业真的是好处多多。相比普通企业来说，高新技术企业所得税15%低税率优惠，并且减免40%，而普通企业所得税税率为25%，这一项税收优惠就已经令很多企业望尘莫及了。再例如，高新技术企业 职工教育经费支出，不超过工资薪金总额8%的部分，准予税前扣除，而普通企业的扣除比例为2.5%；并且中小高新企业转增资本个人所得税可以在5年之内分期纳税，普通企业则必须当年缴纳。另外对企业研发费用，按50%加计扣除或按照无形资产成本的150%摊销、符合条件的技术转让所得可以减免企业所得税，这两项对所有企业都适用的税收优惠，更是让高新技术企业占尽先机。
高新技术企业认定税务风险
但是对取得高新技术企业资格且享受税收优惠的高新技术企业，税务部门如在日常管理过程中发现其在高新技术企业认定过程中或享受优惠期间不符合《认定办法》第十一条规定的认定条件的，应提请认定机构复核。复核后确认不符合认定条件的，由认定机构取消其高新技术企业资格，并通知税务机关追缴其证书有效期内自不符合认定条件年度起已享受的税收优惠。

应对高新技术企业财务核算进行税务合规性管理，需要重点关注几大问题：
其一、高新技术政策与研发费加计扣除政策的区别，不要将两者混淆，造成税务风险；
其二、研发领料退回或者下脚料收入应冲减研发费用；
其三、按照企业所得税汇算清缴申报表的条目单独归集研发费加计扣除的研发费；
其四、研发费加计扣除不再需要到科技部门立项，企业自主立项即可。